Reşit Özkanca Kimdir?

Prof.Dr. REŞİT ÖZKANCA

Research Area : Microbiology

İstanbul, Turkey

e-mail: resitozk@gmail.com

EDUCATION

1989-1993          Ph.D.     Microbology,      Biological Sciences, University of Warwick, Coventry, UK

1987-1989            M.S.       Science Institutes, Biological Sciences, Ondokuz Mayis University, Samsun, Turkey,

1982-1986            B.S.        Biological Sciences, Faculty of Education, Ondokuz Mayis University, Samsun, Turkey,

EXPERIENCE

2013-Present,    Full Professor, Canik Basarı University, Molecular Biology and Genetic Department

2009-2013            Full Professor, Meliksah University, Science Institutes

2004-2009            Full Professor, Faculty of Science and Arts, Biological Sciences, Ondokuz Mayis University

1998-2004            Associate Professor, Faculty of Science and Arts, Biological Sciences, Ondokuz Mayis University

1989-1998            Associate Professor, Faculty of Education, Biological Sciences, Ondokuz Mayis University

1987-1994            Assistant, Faculty of Education, Biological Sciences, Ondokuz Mayis University

RESEARCH

General Microbiology, Environmental Microbiology, Biology Education, Proteomics, Microbiology and Health

 PUBLICATION

  1. Guray Erener,G.,  Ocak,N., Ozturk, E., Cankaya, S., ÖZKANCA, R., Altop, A. 2020. Evaluation of olive leaf extract as a growth promoter on the performance, blood biochemical parameters, and caecal microflora of broiler chickens. R. Bras. Zootec., Bras. Zootec., 49: e20180300. https://doi.org/10.37496/rbz4920180300
  2. dil Ö, Darcan C, Özen T, ÖZKANCA, R (2013).  The Effect of UV-A and Various Visible Light Wavelengths Radiations on Expression Level of Escherichia coli Oxidative Enzymes in Seawater.  Jundishapur J Microbiol. 6(3), 226-32.ÖZKANCA REŞİT,ÖZEN TEVFİK,DARCAN CİHAN,İDİL ÖNDER (2013). The effect of UV-A and various Visble light wavelengths radiations on expression level of E.coli oxidative enzymes in seawater. Jundishhabur Journal of Microbiology, 6, 230-236.
  3. İdil Onder, Darcan Cihan, öZKANCA Resit (2011). The Effect of UV-A and Different Wavelengths of Visible Lights on Survival of Salmonella typhimurium in Seawater Microcosms. Journal of Pure and Applied Microbiology, 2(5), 581-592.
  4. O İdil, R Özkanca, C Darcan, KP Flint (2010). Escherichia coli: Dominance of Red Light over Other Visible Light Sources in Establishing Viable But Non-Culturable State. Photochemistry and Photobiology, 1(86), 104-109.
  5. R ÖZKANCA, K IŞIK, F SARIBIYIK, N SAHİN, E KARİPTAŞ, KP FLİNT (2009). Resuscitation and quantification of stressed Escherichia coli in water samples. Microbiological Research, 2(164), 212-220.
  6. Darcan C, Özkanca R, İdil Ö (2009). The role of RpoS, H-NS and AcP on the pH-dependent OmpC and OmpF porin expression of Escherichia coli at different pH. African Journal of Biotechnology, 9 (8), 1845-1854.
  7. R ÖZKANCA, K Işık, F Sarıbıyık, N Sahin, E Kariptaş, K P Flint (2009). Resuscitation and quantification of stressed Escherichia coli in water samples. Microbiological Research, 2(164), 212-220.
  8. C Darcan, R ÖZKANCA, Ö İdil, KP Flint (2009). The Viable But Non-Culturable State of Escherichia coli Related to EnvZ Under the Effect of pH, Starvation and Osmotic Stress in Sea Water. Polish Journal of Microbiology, 4(58), 310-317.
  9. Genç Y, Özkanca R, Bekdemir Y (2008). Antimicrobial activity of some sulfonamide derivatives on clinical isolates of Staphylococcu aureus. Annals of Clinic Microbiology and Antimicrobials, 7(7), 17-20.
  10. Odabaşoğlu M, Albayrak Ç, Özkanca R, Aykan F Z, Lonecke P (2007). Some polyhydroxyl azo- azomethine derivatives of salicylaldehyde: Syhthesis, characterisation, spectroscopic, moleculer structure and antimicrobial activity studies. Journal of Molecular Structure, 840(840), 71-89.
  11. ÖZKANCA R, FLİNT KP (2003). The effect of starvation stress on the porin protein expression of Escherichia in lake water. Letters in Applied Microbiology, 6(35), 1-5.
  12. Darcan C, Özkanca R, Flint KP (2003). Survival of non-specific porin deficient mutants of Escherichia coli in Black Sea Water. Lett. Appl. Microbiol, 5(37), 380-385.
  13. Yılmaz VT, Yazıcılar TK, Cesur H, Özkanca R, Maras FZ (2003). Metal Complexes of phenylpiperazine based dithiocarbamate ligands. Synthesis and Reactivity in İnorganic and Metal chemistry, 33(33), 589-605.
  14. ÖZKANCA REŞİT (2002). Beta-Galactosidase activity of Escherichia coli under long-term starvation, alterations in temperature, and different nutrient conditions in lake water. Int. Microbiol, 3(5 ), 127-132.
  15. Özkanca R, Şahin N, Işık K, Kariptaş E, Flint KP (2002). The effect of toluidine blue on the survival, dormancy, and outer membrane porin proteins (OmpC, OmpF) of Salmonella typhimurium LT2 in seawater. Journal of Applied Microbiology, 6(92), 1-8.
  16. Şahin N, Öztürk E, Işık K, KARİPTAŞ E, ÖZKANCA R (2001). Selective isolation and nümerical classification of noval thermophilic Streptomycetes.. Turkish J. Biology(26), 13-24.
  17. KARİPTAŞ E, IŞIK K, ŞAHİN N, WARD AC, ÖZKANCA R (2000). The Analysis of Rhodococcus ruber in Different Growth Conditions Using Pyrolysis Mass Spectrometry (PyMS). Turkish J. of Biology, (24), 1-8.
  18. ÖZKANCA R, İDİL Ö, ŞAHİN N (1997). Antibiotic susceptibility and survival of Escherichia coli ve Salmonella enteritidis in sea water under starvation stress.. Turkish Journal of Biology(21), 471¬478.
  19. Ozkanca R, Flint KP (1997). Relation between respiratory enzymes and survival of Escherichia coli under starvation stress in lake water. Journal of Applied Microbiology, 3(82), 301-309.
  20. ÖZKANCA R, FLİNT KP (1996). The effect of antibiotics on the survival of Escherichia coli in untreated and filtered-autoclaved lake water at different temperatures. Turkish Journal of Biology (20), 339-350.
  21. ÖZKANCA REŞİT (1996).Survival and detection of viable but non-culturable Escherichia coli in lake water. Doğa Turkish Journal of Biology(20), 87-97.
  22. Ozkanca R, Flint KP (1996). Alkaline phosphatase activity of Escherichia coli starved in sterile lake water microcosms. Journal of Applied Bacteriology, 3(80), 252-258.
  23. ÖZKANCA REŞİT (1996). The effects of osmotic stress on survival and alkaline phosphatase activity of Aeromonas hydrophila . FEMS Microbiology Letters, 1(137), 19-24.
  24. ÖZKANCA R, FLİNT KP (1995). The effects of nutrient sources on the growth and survival of Escherichia coli in lake water. Turkish Journal of Biology (19), 377-390.
  25. ÖZKANCA R, FLİNT KP (1995). Changes in protein patterns of Escherichia coli under starvation stress. Turkish Journal of Biology (19), 339-406.
  26. Bekdemir Y, Kütük H, Özkanca R, Maraş FZ, Darcan C, Çelik S, Işık K (2004). Substituent effects on Antimicrobial Activities of some sulfonamides. EuroQSAR Proceedings, 174-175.
  27. Darcan C, Özkanca R, Şahin N, Işık K, Kariptaş E (2001). The effect of disinfectants chemicals on outer membrane protein synthesis of Escherichia coli ML30 and Salmonella typhimurium LT2 in sea water. Biyoteknoloji Dergisi, 2(25), 57-66.
  28. ŞAHİN N, İLKNUR Y, IŞIK K, KARİPTAŞ E, ÖZKANCA R (2001).Isolation and numerical taxonomy of neutrophilic-mesophilic streptomycestes.. Biyoteknoloji Dergisi, 1(25), 1-5.
  29. Kariptaş E, Işık K, Şahin N, Özkanca R (2000). Variation of carbohydrate composition of Rhodococcus ruber with different growth conditions. OMÜ Fen Dergisi, 1(11), 61-75.
  30. IŞIK K, KARİPTAŞ E, ŞAHİN N, ÖZKANCA R (1999). Fatty acid composition of some Nocardia strains using pyrolysis Gas Chromotography. OMÜ. Fen Dergisi, 1( 9-10), 29-42.
  31. Şahin N, Özkanca R, Işık K, Kariptaş E (1999). An investigation on Streptomyces population at different soil type. OMÜ. Fen Dergisi, 1( 9-10), 90¬108.
  32. ÖZKANCA REŞİT (1997). The role of starvation stress in bacterial survival strategies. KÜKEM Dergisi(20), 37-48.
  33. ÖZKANCA R, SANİÇ A, GÜNAYDIN M (1995). Sulardaki indikatör ve patojen bakterilerin tayininde karşılaşılan problemler. KÜKEM Dergisi (18), 73-82.
  34. Kılıç M, Özkanca R (1991). The flora of the costal dune of Central Black Sea Region. Doğa-Tr. J. of Botany (15), 314-327.
  35. Kılıç M, Karaer F, Özkanca R (1991). New floristic records from square OMÜ Fen Dergisi, 1(3), 138-151.
  36. Özkanca R, Darcan, C., Aydın, A.2001.The effect of methylene blue on the survival of E.coli ML30, S.typhimurium , K.pneoumoniae and P.aeruginosa in sea water. XII.Biotechnology Congress Procedings.P, 285-288.
  37. Kılıç M, Karaer F, Özkanca R (1991). A new record of flora of Turkey. Doğa-Tr. J. Botany (15), 197-200. 38.
  38. Kılıç M, Özkanca R (1991). The vegetation of the coastal dune of Central Black Sea Region Doğa-Tr. J. of Botany(15), 328-348.
  39. Özkanca, R. 1994 The effect of different environmental conditions on the survival of Escherichia coli and its detection in lake water. XII.Biology Congress Edirne, Turkey. Volum V, P, 19-23.

 PRESENTATION

  1. Özkanca R, Flint KP (1993). Morphological and physiological alterations in Esherichi coli under starvation stress. Starvation and survival of Bacteria, Society for General Microbiology, 126th. Ordinary Meeting, University of Exeter (Poster)
  2. Özkanca R, Flint KP (1992). Survival and physiological status of Escherichia coli under starvation stress. Sixth International Symposium on Microbial Ecology (ISME-6)
  3. Özkanca R, Darcan C, İdil Ö (2008). Effect of different wavelength of rays on lipid peroxidation of E.coli and S. typhimuriumn. 19th National Biology Congress,
  4. Darcan C, Özkanca R, İdil Ö (2008). Role of RpoS, H-NS, Acp and the effect of starvation stress in seawater and nutrition addition on E.coli OmpC and OmpF synthesis. 19th National Biology Congress,
  5. Darcan C, İdil Ö, Özkanca R (2005). Relation of E.coli existence in seawater, under pH, starvation and osmotic stress conditions, with dormancy and porin proteins. XIV. National Biotechnology Congress,
  6. İdil Ö, Darcan C, Karakaya H, Özkanca R (2005). Effect of oxidative stress and different wavelength rays on seawater E.coli and S.typhimurium to go under dormancy. XIV. National Biotechnology Congress,
  7. İdil Ö, Darcan C, Karakaya H, Özkanca R (2005). Relation of oxidative stress enzyme activity of seawater E.coli and S.typhimurium with photosynthesizer methylene blue and different wavelength of rays. XIV. National Biotechnology Congress,
  8. Darcan C, İdil Ö, Özkanca R (2005). In different pH values the role of RpoS, HNS, and AcP on the porin protein synthesis of OmpC and OmpF. XIV. National Biotechnology Congress,
  9. Kariptaş E, Işık K, Şahin N, Özkanca R (2001). Effect of Rhodococcus rhodochrous (Zopf 1891) Tsukamura 1974 AL on growth phases on fatty acid composition. XII. National Biotechnology Congress
  10. İdil Ö, Darcan C, Özkanca R (2001). Effect of some chemical disinfectants on the survival of Escherichia coli and Salmonella enteritidis that live in black sea. XII. National Biotechnology Congress
  11. Özkanca R, Darcan C, Aydın A (2001). Effect of photosynthesizer methylene blue on the survival of seawater Escherichia coli ML30, Salmonella typhimurium, Klebsiella pneumoniae andPseudominas aeruginosa. XII. National Biotechnology Congress,
  12. Işık K, Şahin N, Kariptaş E, Özkanca R (2001). Determining some Nocardia species by Molecular method that is Ribotyping. XII. National Biotechnology Congress,
  13. Işık K, Kariptaş E, Şahin N, Özkanca R (2000). Determining some clinically important Nocardia species by digoksigenin ribosomal DNA probe. XV. National Biology Congress,
  14. Darcan C, Özkanca R (2000). Effect of some disinfectant in seawater on protein synthesis of Escherichia coli ML30 and Salmonella typhimurium LT2. XV. National Biology Congress,
  15. İdil Ö, Özkanca R, Şahin N (1998). Changes in antibiotic resistance of E.coli ve S.enteritidis that lives in chemically contaminated seawater. XIV. National Biology Congress,
  16. Özkanca R, Flint KP (1996). Relation between respiration enzymes and survival strategy of E.coli under starvation stress. XIII. Biology Congress,
  17. Özkanca R, Şahin N, İdil Ö (1996). Changes in antibiotic resistance of E.coli ve S.enteritidis that are pretreated with different chemical substances. XIII. National Biology Congress,
  18. ÖZKANCA REŞİT (1996). Effect of starvation stress and temperature on outer membrane porin proteins (OmpC, OmpF, OmpA) of lake water Esherichia coli. XIII. National Biology Congress,
  19. Şahin N, Özkanca R, İdil Ö (1996). A research on Streptomyces population in different soils that host different plant populations. XIII. National Biology Congress, Istanbul,
  20. ÖZKANCA REŞİT (1995). Effect of osmotic stress on the survival and metabolic activity of lake water Escherichia coli. IX. KUKEM Congress,
  21. ÖZKANCA REŞİT (1995). Effect of metabolic inhibitors on the survival of lake water E.coli. II. National Ecology and Environment Congress,
  22. ÖZKANCA REŞİT (1994). Escherichia coli and dormancy. XII. National Biology Congress,
  23. Özkanca R, Flint KP (1994). Effect of different environmental factors on lake water Escherichia coli and its effect on detectibility. XII. National Biology Congress,
  24. Öztürk E, Şahin N, Işık K, Kariptaş E, Özkanca R (2001). Isolation of Thermophilic Streptomyces and their numeric taxonomy. XII. National Biotechnology Congress,
  25. Kariptaş E, Işık K, Şahin N, Özkanca R (2000). Effect of Rhodococcus ruber on fatty acid composition growth phases. XV. National Biology Congress,

Published Books

  1. Aquatic Microbiology (2014), OZKANCA RESIT, Surat Yayinlari, Editor: Resit OZKANCA, Publication number: 1, Turkish.

PROJECT

  1. The determining Survival and strategies of mutant E.coli in terms of environmental sensors and outer membrane porin proteins (OmpC, OmpF, OmpC-OmpF, EnvZ, OmpR) in sea water. Suppoted by Turkish research Council (TUBITAK).
  2. Detection viable but non-culturable E.coli by developping potansiyometric biosensor. Suppoted by Turkish research Council (TUBITAK).
  3. Isolation and taxonomy of Actinomycetes collected from Caves located Middle Black Sea Region in Turkey. Supported by Ondokuz Mayis University Researc Fund.
  4. The effect of Olive Leaf Extract on the Broiler performance’ some blood parameters and Intestinal Microflora of Blind intestine. Supported by Turkish research Council (TUBITAK).
  5. Project education workshop of Biology teachers. Samsun region, Turkey Supported by Turkish research Council (TUBITAK).
  6. Biology Project education workshop of teachers Kayseri region, Turkey Supported by Turkish research Council (TUBITAK).
  7. Project education workshop of Biology teachers Amasya region, Turkey Supported by Turkish research Council (TUBITAK)
  8. A workshop on Project education of Biology, chemistry, physic, and mathematic teachers in Tokat region Supported by Turkish research Council (TUBITAK)
  9. Project based workshop of Biology education on undergraduate students in Tokat region. Supported by Turkish research Council (TUBITAK)
  10. Different environmental parameters effects on enteric bacterial survival and outer membrane porin proteins. Ondokuz Mayıs University Research Funding. Project Number:F-271 2001-2004
  11. Photooxidation and some photosensitisers substrat on some enteric bacterial survival and its metabolisms. Ondokuz Mayis University Research Funding. Project Number: AF-324
  12. Determination of dormant Salmonella typhimurium by via metabolic activities under different environmental stress conditions. Project Number: E-051. Suppoted by Ondokuz Mayis University, Research Fund. 1994
  13. Biotic and abiotic factors effecting coliform bacteria in Black Sea Water. Project Number: E-059. Suppoted by Ondokuz Mayis University, Research Fund. 1995
  14. The effect of ammonium ions on the survival of E.coli in sea water. Project Number: EF-072. Ondokuz Mayis University, Research Fund. 1996
  15. Metabolic effects of natural radiation, short wavelength rays and photosensitizers on indicators and pathogen bacteria. Project Number: EF-082. Ondokuz Mayis University, Research Fund. 1997

Advised Dissertations

Master of Science

  1. GENÇ YELİZ, (2005). Antimicrobial activity of some sulfonamide derivatives on clinical isolates of Staphylococcu aureus, Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences
  2. MARAŞ FATMA ZEHRA, (2003). Antimicrobial activities of newly synthesized sulfonamit and sulfomat derivatives. Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences
  3. AYDIN ARZU, (1999). Photooxidation and some photosensitisers substrat on some enteric bacterial survival and its metabolisms. Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences
  4. DARCAN CİHAN, (1999). Effect of some disinfectant in seawater on protein synthesis of Escherichia coli ML30 and Salmonella typhimurium, Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences
  5. ÖZEREN AHMET, (1997). The effect of ammonium ions on the survival of E.coli in sea water, Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences
  6. İDİL ÖNDER, (1997). Biotic and abiotic factors effecting coliform bacteria in Black Sea Water, Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences

Advised PhD Thesis

  1. GENÇ YELİZ, (2011). Developping potansiometric E.coli biosensor for using natural environments, Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences.
  2. İDİL ÖNDER, (2006). Relation of oxidative stress enzyme activity of seawater E.coli and S.typhimurium with photosynthesizer methylene blue and different wavelength of rays. Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences.
  3. Cihan Darcan, (2007). The effect of pH, osmolarity, and starvation stress on E.coli outer membrane porin protein synthesis. Ondokuz Mayis University/Science Institute/Biological Sciences.

Managing Duties

  • Editor of Ondokuz Mayıs University Science Journal

SCHOLARSHIPS AND AWARDS

  • Royal society awards

SERVICE

  • Editor of Ondokuz Mayıs University Science Journal

SCHOLARSHIPS AND AWARDS

  • Royal society awards
  • TEACHING EXPERIENCE
Academic Year somestry Lecture Name Hours in a Week Number of Students
Theoritical Practical
2014-2015 Fall Microbiyology I   3   2 30
Biyotechnology   3   0  5
Spring Microbiyology II   3   2  30
Moleculer Microbiyology (MsC and PhD)   3   0   2
2015-2016 Fall Microbiyology I

Microbiyology Lab I

Moleculer Genetic Lab

Virology

Biyoteknoloji (Lisans Üstü)

3

0

0

3

3

0

3

3

0

0

38

38

30

30

2

Spring Microbiyology II

Microbiyology Lab II

Industrial Biotecnology

Moleculer Microbiology(MsC, PhD)

3

3

3

3

0

0

0

0

38

38

28

5

Note: Before this date, since 1994, I have also tought many lectures related to Microbiology

 

Mitekondri DNA’sının çocuğun karekterine etkisi

Çevremizdeki insanlar kişiliğimizin oluşmasında anne, baba ya da çevremizin mi daha etkili olduğunu merak eder. Bir çocuğun nasıl geliştiğini belirleyen nedir? Bir çocuğun nasıl bir kişiliğe ve karektere sahip sahip olacağına etki eden her faktörü bilmemiz mümkün değil fakat araştırmacılar bilgi birikimiz çerçevesinde bazı etkenleri her yönden araştırmaktadırlar. Bunlar genetik, ebeveynlerin tutum ve davranışları, çocuğun deneyimleri, ve edinilmiş tecrübeler, arkadaş çevresi, aile ortamı, ekonomik yeterlilik, eğitim ve ilişkiler gibi şeyleri içermektedir. Araştırmacılar, bu faktörlerin rolünü anlayarak, bu tür etkilerin çocukların gelişimine nasıl katkıda bulunduğunu daha iyi belirleyebilirler. Kendi genel kişiliğinizi düşünün. Bugün sizin ne kadarınız genetik geçmişinizle ne kadarı.?

Bu soru yüzlerce yıldır felsefe, psikolog ve eğitimci, biyolog ve araştırmacıların konusu olmuştur. Doğanın (genetik alt yapımız, Nature) veya beslenmenin (çevremiz, Nurture) sonucu muyuz? Bugün, çoğu araştırmacı, çocuk gelişiminin hem genetiğin ve hem de beslenmenin karmaşık bir etkileşimini içerdiği konusunda hemfikirdir. Gelişimin bazı yönleri biyolojiden güçlü bir şekilde etkilenebilirken, çevresel etkiler de bir rol oynayabilir. Örneğin, ergenliğin başlangıcının ne zaman meydana geldiği zamanlaması büyük ölçüde kalıtımın sonucudur. Ancak beslenme gibi çevresel faktörlerin de bir etkisi de olabilir. İnsanlık tarihinin en eski dönemlerinden beri kalıtımın ve çevrenin etkileşimi, çocukların kim olduğunu ve kim olacağının biçimlendirilmesinde etkili olmuştur. Bir çocuğun ebeveynlerinden miras aldığı genetik talimatlar gelişim için bir yol haritasını oluştururken, bu yol haritası çevrçevesinde bu davranışların nasıl kontrol edileceği, nasıl şekilleneceğini ise çevresel faktörler ile birlikte etkileşim halinde belirler. Doğanın ve çevrenin karmaşık etkileşimi yalnızca belirli anlarda veya belirli zaman aralıklarında gerçekleşmez, kalıcı ve ömür boyu sürer.

Bu makalede, biyolojik etkilerin çocuğun gelişimini şekillendirmesine nasıl yardımcı olduğunu daha yakından inceleyeceğiz. Deneyimlerimizin genetik ile nasıl etkileşime girdiği hakkında daha fazla şey öğreneceğiz.

İNSAN VE GENETİK

Genetik yapı canlının kalıtımsal özellikleridir. İnsan fiziksel özelliklerin yanında davranışsal bazı özellikler de doğuştan getirilir. Psikolojide kalıtım yoluyla edinilen özelliklere  doğuştan gelen karekterler denir. İnsan davranışlarında çevrenin de etkisi vardır ki, bu etkilere kazanılmış  karekterler denir. Bazı durumlarda ise hem genetik ve hemde çevrenin ortak etkileşimi sonucu ortaya çıkabile karekterler vardır. Örneğin şarkı söyleyebilme, hızlı düşünme, oyun oynama kabiliyeti, muhakeme yapabilme, fiziksel yapı, sosyal çevrenin de etkisi ve katkısıyla davranışların şekillenmesinde önemli bir yere sahiptir. Ama bu özellikleri de genetik potansiyelden bağımsız düşünemeyiz. Çünkü zihinsel potansiyel veya zeka kapasitesi yukarıda verilen örneklerle doğrudan ilişkilidir. Doğuştan ve edinilmiş donanımın etki miktarı davranışın türüne göre değişir.  Örneğin tek yumurta ikizlerinin zekâları arasında genetiğin etkisinin %88 ilişki olduğu bir çalışmada belirlenmiştir. Fakat farklı sosyal ve kültürel ortamlarda ve çevrelerde büyütülen tek yumurta ikizlerinde ise kişiliğin ve karekterlerindeki benzerlik oranı azalmaktadır. Aynı yumurta ikizlerin aynı gen yapısını taşıması nedeniyle, bu çocukların üzerinde çevrenin de etkisinin anlaşılmasında çok sayıda bilimsel çalışma yapılmıştır.  Burada önce ökaryotik genetiğin etkisi ve sonra çevrenin etkisini inceleyelim.

İnsan genomunda iki kalıtsal materyal vardır. Birincisi annenin ve babanın karekterlerini birleştiren  çekirdek DNA’sı yani kromozomlar, diğeri ise anneden ağırlıklı olarak geldiği kabul edilen mitekondri DNA’sıdır (mtDNA). Gelişimin en erken döneminde en başında, bir çocuğun gelişimi, erkek üreme hücresi veya sperm, dişi üreme hücresini yumurta hücresi ile birleşmesi ile başlar. Sperm ve yumurtaların her biri, yeni gelecek yavrunun tüm özelliklerinin oluşmasını belirleyecek olan çekirdeklerindeki kromozomları içerir. Bu kromozomlar yapısal olarak sarmal bir yapıdan oluşan şifre dizilerinden oluşmaktadır. Her bir gen farklı sayıda nükleotit dizilerinden oluşmaktadır. Bu kromozomlarda bulunan genler, tüm yaşamı oluşturan genetik kodu veya talimatları içeren DNA (deoksiribonükleik asit) olarak bilinen kimyasal bir yapıdan oluşur. Sperm ve yumurta dışında, vücuttaki tüm hücreler 46 kromozom içerir. Tahmin edebileceğiniz gibi, sperm ve yumurtaların her biri sadece 23 kromozom içerir.

Bu, iki hücre bir araya geldiğinde ortaya çıkan yeni organizmanın  vücüt hücrelerinde sabit 46 kromozom olmasını sağlar. Peki, her iki anne ve babadan genetik genetik kodlar, çocuğun gelişimine ve sahip olacakları özelliklere tam olarak nasıl etki eder? Bunu tam olarak anlamak için, öncelikle çocuğun genetik kalıtımını ve bu genlerin etkinlik derecesine göre gösterecekleri metabolik faaliyet çok önemlidir. Bu genlerin aktivite potansiyeli sonucunda ortaya fiziksel bir görünümü çıkar. Fiziksel görünüm (fenotip) dış görünüm anlamına gelir. Bir genotip, bir kişinin anne-babadan aldığı aldığı tüm genleri ifade eder. Fenotip ise boyu ve saç, deri rengi, veya göz yapısı, vucüt yapısı gibi fiziksel özellikleri yanında, ayrıca utangaçlık, duygusallık dışa dönüklük gibi bir çok fiziksel olmayan özellikleri içerebilir. Ruh sağlığı ve hastalığı, bilişsel yetenekler, kişilik, okul başarısı, hemen hemen psikolojinin tüm alanları için çok önemlidir. Genlerin etkinliği ve kendini gösterebilmesi anne ve babadan gelen kromozomlar üzerinde gen lokuslarındaki homolog bölgelerdeki genlerin baskınlık (dominantlık), resesiflik (çekiniklik) ve eşbaskınlık şeklinde kendini ifade etmesine bağlıdır. Yani anne veya baba hangi özellik baskınsa o özellik ortaya çıkacaktır. Veya her iki kromozomdan çekinik genler eşleşirse çekinik karekter ortaya çıkacaktır. Bazı eşleşen genler ise ortak etki göstererek, ikisinin arası bir özelliğin ortaya çıkmasını sağlar.

Mitekondri DNA’sı (mtDNA) ve kalıtım

İnsan mitokondrial DNA (mt.DNA)’si, hücre stoplazmasında bulunan, sayısal olarak anneden daha fazla gelen, 16.569 baz çifti içeren küçük, çift zincirli, hücre stoplazması içerisindeki mitekondrilerede bulunan sirküler bir moleküldür. Mitokondri ökaryotik hücrelerin, enerji üretimi görevini üstlenen ve kendi DNA’sına sahip sitoplazmik bir organeldir. Sayıları enerji ihtiyacına göre, hücreden hücreye değişen mitokondriler, 1-7 mikrometre uzunluğunda çubuk şeklinde veya 2-3 mikrometre çapında küresel yapılardır. küçük, çift zincirli, sirküler bir moleküldür. Bu sirküler kromozom herbiri kendi başına replike olabilen hafif (L) ve ağır (H) zincirden oluşur. mtDNA’nın çekirdek DNA’sından bağımsız replikasyon ve transkripsiyon sistemi vardır. Ancak mtDNA’nın replikasyon ve transkprisyonu için gerekli enzimler, çekirdek DNA’sı tarafından sentezlendiğinden, mt DNA tam bir otonomiye sahip değildir. Mitokondrial genom 37 gen içerir. Bunlardan 13’ü solunum zincirindeki yapısal proteinleri (Nikotinamid Adenin Dinükleotit Dehidrogenaz, Sitokrom C oksidoredüktaz, sitokrom C oksidaz ATP sentetaz) kodlarken, 2’si RNA ve 22’si de tRNA genlerini kodlar.

Mt.DNA’nın çekirdek DNA’sından bağımsız replikasyon ve transkripsiyon sistemi vardır. Ancak mt.DNA’nın replikasyon ve transkprisyonu için gerekli enzimler, çekirdek DNA’sı tarafından sentezlendiğinden, mt DNA tam bir otonomiye sahip değildir.Mitokondriyal DNA‘nın (mtDNA) sadece anne yumurta hücrelerinden geçtiğine inanılır ve babalık katkısı yoktur diye güçlü bir kanı vardır.  Bu görüşe göre sadece mitokondriyal DNA anneden gelir bizlerin mitokondri DNA‘sı annemizden bize kalmıştır düşüncesi yaygın bir şekilde kabul edilmektedir. Ama son zamanlarda yapılan çalışmalar babanın mtDNA ‘sını yavrularına aktarabileceğine dair güçlü kanıtlar sunulmaktadır. Mitekondrilerin yavruya geçişinde anne ağırlığı olduğu bir gerçek. Bu kabulun nedeni İnsan yumurtaları 100,000 kopyadan daha fazla mtDNA içerirken, sperm yaklaşık 100 kopya içermesidir . İlk hipotezler, baba mtDNA moleküllerinin döllenmiş yumurtadaki anne mtDNA‘lara göre sayıca seyreltildiği bilinmektedir. Araştırmacılar onlarca yıldır sağlıklı organizmaların neden hücresel güçlerini sadece anneden aldıklarını ve bu şekilde miras kalan mitokondriyal genlerin sağladığı olası evrimsel avantajlar üzerine tartışmaktadır. Bu nedenle yahudilik inancında, anne tarafında gelen mitekondri genomunun yüzlerce yıl değişmediğinden ve aynı kaldığına inanıldığından, anne tarafından gelenler gerçek yahudi olarak kabul edilmektedir. Ama bazı canlılarda yapılan çalışmalarda az da olsa babadan gelen mtDNA’nın da yavruya aktarıldığını bilimsel yayınlarda sunmaktadırlar Fakat son yıllarda yapılan genetik çalışmalar bu tezleri zayıflatmaktadır. Örneğin 2002 yılında New Scientist dergisinin internet sitesinde yayınlanmış ve Danimarkalı bir hastanın mitokondrilerini %90 oranında babadan aldığının anlaşıldığı bildirilmiştir.

Bir başka çalışmada, insan poliploid embriyolarını kullanan ve daha önce yapılan insan çalışmaları, gelişimin sekiz hücresi aşamasına kadar ancak baba mtDNA’yı tesbit edebilmişti. Bununla birlikte, 2002 yılında, anne ve baba mtDNA’yı ifade eden, kasları etkileyen bir durum olan mitokondriyal miyopatisi olan erkekle ilgili bir rapor yayınlanmıştır. Bu gözlem, insanlarda (yosunlar, bitkiler, maya ve Drosophila dahil olmak üzere) katı baba mtDNA mirasını sergilemesi bakımından önemlidir.

Bu çalışmanın bilimsel, tıbbi ve etik yönden ispatlanabilmesi için daha fazla bilimsel veri gerekmektedir. İlk olarak şu sorulara cevap verilmesi gerekir;. Baba mtDNA’nın döllenmiş yumurta hücresi tarafından ortadan kaldırıldığının kesin mekanizmasının bilinmesi gerekir.  İkinci soru, baba mtDNA aktarımının mtDNA işlemindeki bir nadir mutasyondan mı kaynaklanmaktadır yoksa normal mitokondriyal metabolizmanın bir sonucumudur ? Son olarak, mtDNA’nın babadan gelen bir kalıtımsal işlem olduğunun oranı nedir ?.

Bu soruların cevapları geçmiş ve gelecekteki tıbbi çalışmaları etkileyecektir. Anne ebeveynden genetik kökenleri inceleyen birçok çalışma yapılmıştır. Örneğin, 2017’den bir çalışma, otizm ile belirli mitokondriyal haplotipler arasında bir genetik bağlantı  olduğu tesbit edilmişti. Bilinen Kalıtsal mt DNA hastalıkları;  a) Substrat taşınım defektleri, b) Substrat kullanım defektleri c) Krebs siklusu defektleri, d) Oksidasyon fosforilasyon defektleri  e) Respiratuar zincir defektleri, f) Protein taşınım defektleri.

Tarihsel bir bakış açısıyla, baba mtDNA iletimi, tüm yaşayan insanların anne ataları olan “mitokondriyal Havva” ile ilgili iki klasik ama tartışmalı raporun yeniden yorumlanmasına yol açabilir. 1987 yılında, bilim adamları, “tüm mitokondriyal DNA’ların bir kadından kaynaklandığını” ve muhtemelen yaklaşık 200,000 yıl önce Afrika’da yaşadığını gösteren dünya çapında bir insan mtDNA anketinin sonuçlarını yayınlamışlardı. Havva, 200.000 yıl önce yaşamış olan tüm insanların annesini doğrulamak için mitokondriyal genomların önemli geçerli bir delildir.

Etik açıdan bakıldığında, baba mtDNA geçişinin ne kadar yaygın olduğu sorusu özellikle önemlidir. Geçtiğimiz yıl anne yolla aktarılan mitokondriyal genetik belirteçler olan K1a1b1a, K1a9, K2a2a ve N1b’nin Aşkenaz Yahudileri arasında yaygın olduğu, ancak nadiren başkalarında görüldüğü rapor edildi. Yahudilik sadece anneden aktarıldığına inanıldığı için, bu genetik göstergeler birine sahip olan birçok İsrail rabbinist uzmanı tarafından Yahudi soylarının belirlenmesinde güvenilir bir yasal ve dini göstergesi olarak görülmüştür.

Çocuğun gelişiminde  çevrenin etkisi

Genel anlamda, davranış genetikçileri, çocukların genetik donanımları, diğer çocuklara kıyasla bireylerin nasıl etkilendiklerini açıkça ortaya koymuşlardır. Rowe’nin kitabı, Aile Etkisi Sınırları (1994), ve Harris’in daha popüler kitabı olan Nurture Varsayımı (1998)’ında ebeveynlerin  ve genetiğin çocukların gelişimine olan etkilerini birlikte  anlatan kitapları ile konuya ışık tuttular.

Modern toplumlarda, çocuklukta sosyalleşmenin gerçekleştiği en az üç ana bağlam vardır, aileler, akran grupları ve çocukların günlük deneyimlerinin yapılandırıldığı ve denetlendiği okul sınıfları veya gündüz bakım merkezleri gibi ev dışı ortamlar. Çocuklukta sosyalleşme de ebeveynlerin çok önemli rolü olduğu literatürde desteklenmektedir. Atasözü  “Ağaç  yaşken eğilir” ebevynlerin çocuğun gelişimindeki rolünü niteler. Zaten çocuk gelişiminde 5-7 yaş aralığı karekter gelişiminde önemli olduğu bilinmektedir. Çocukları, büyüdükçe onları denetleyerek, öğreterek ve disipline ederek arzulanan şekilde gelişimini sağlamak ebeveynlerin en önemli amaçlarındandır. Özellikle erken çocukluk döneminin, insanların özellikle esnek olduğu yaşam evresinin, çocukların özellikle ailesini terk ettikten sonra, sosyal etkilere açık olduğu bir dönem olduğu olduğu bilinmektedir. Çocukların yaşamlarının ilk 5-7 yılında etkilenmeye özellikle yatkın olduğu düşünülen şeyler, konuştukları dil, yiyecek tercihleri, dini inançları ve bazı kalıcı kişilik özelliklerini içerir.

Doğanın genetik olduğunu (nature), beslenmenin (nurture) çevre olduğunu söylüyoruz. Bu iki faktörün insan davranışındaki etki ağırlığı veya ortak etkileri uzun zamandır devam etmektedir. Nature  or Nurture. Genetik biliminin gelişimine kadar insan davranışında çevrenin büyük etkisinin olduğu kabul edilmekteydi. Ama 1960 yılından sonra ikizler ve evlat olarak edinilmiş çocuklar üzerinde yapılan yoğun çalışmalar, genetiğin etkisinin anlaşılmasında çok önemli aşama olmuştur.  Aslında davranış genetik tekniklerin kullanılması yüz yıl kadar geriye gider;

Davranışşal Genetikte İkiz Çalışmaları

İkiz çalışmalarının ilki, 19.yy başlarında öncelikle İngiltere’de, aynı zamanda diğer Avrupa ülkelerinde de yapıldı. İkiz yöntem, iki tip ikizin karşılaştırılmasını içerir. Dünyadaki bütün doğumların %1’i ikizdir. Bunların 1/3’ü tek yumurta ikizidir. Bunlara monozigotik yani aynı yumurta ikizi denir. Bu ikizler döllenmiş bir yumurtanın, zigot aşamasında bölünmede meydada gelen bir durumdan dolayı, aynı DNA’ya sahiptirler ve birbirlerinin klonları gibidirler. Ayrı yumurta ikizleri ise, her erkek ve kız kardeşi gibiler ama aynı rahim içinde aynı anda gelişirler. İkiz yöntem bu iki grubun karşılaştırılmasından oluşur. Dört bin makalede incelenen 15 milyon ikizlerle yapılan anketler davranışlarda genetiğin daha ağırlıklı olduğu göstermiştir.

İkizleri davranışsal genetiğik kullanılmasının sebebi, örneğin aynı yumurta ikizlerinin birisinde müzik yeteneği varsa, diğerinde de olması gerekir ve bu genetik bir etki olarak değerlendirilir. Çünkü bunlar aynı ailede aynı rahimde ve aynı genetiğe sahip olduğunda bu sonuç beklenir. Ayrı yumurta ikizilerinin ise genetik yapıları farklı fakat yaşadıkları çevre ve beslenme ortamları aynı. Bu durumda çevrenin etkisi daha iyi değerlendirilebilir. Diğer yöntem ise evlat edinme yöntemidir. İkiz yöntem biyolojik bir deney gibi izlenmektedir. Bu ikizlerden biri evlatlık olarak verilir ve sosyal bir deney olarak takip edilir. Ebeveynler ve yavru genetik olarak% 50 oranında birbirine benzerdir. Fakat evlat edinilen çocuklar evlat edinen aileye verilir, çünkü evlat edinen ebeveynler çevre farklı çevre olarak kabul edilir. Bu gözlemler sonucunda iki farklı ortamda yetişen aynı yumurta ikizlerinin davranışlarında genetiğin ve çevrenin etkisi belirlenmeye çalışılır. Bu çalışmalarda ikizlerin davranışlarında genetiğin çok önemli rol oynadığı ortaya konmuştur. Şimdi yapılan çalışmalar da bu etkiler ne zaman etkin olmaya başlamaktadır.

Aynı yumurta ikizlerinin genlerinin %100 aynı olmasına rağmen değişik çevresel faktörler nedeniyle aralarında farklılıklar olabilmektedir. Bunun nedeni, bazı araştırmalar tek yumurta ikizlerindeki farklılıkların nedeninin epigenetik adı verilen biyolojik bir süreç olduğunu gösteriyor. Genler bir organizmanın büyüme ve gelişim sürecinde canlılığın devam etmesi için gerekli temel biyokimyasal süreçlerden sorumludur ve bu süreçlerin gerçekleşmesini sağlayan makromoleküller, örneğin proteinler genetik materyaldeki bilgiler kullanılarak sentezlenir. Buna gen ifadesi denir. Epigenetik süreç, genetik materyalin yapısında yani DNA diziliminde değişime neden olmaksızın gen ifadesini değiştirir. Örneğin DNA molekülüne bağlanan metil grubu epigenetik değişime neden olur ve genetik materyalin belirli bir genin ifadesinden sorumlu kısmının etkinliğini değiştirerek bu genin kodladığı proteinin sentezini engelleyebilir. Son yıllardaki araştırmalar çevresel faktörlerin epigenetik değişimlere neden olduğunu gösteriyor. Bu durumun DNA dizilimleri aynı olan tek yumurta ikizlerindeki farklılıkların sebebi olduğu düşünülüyor. Ama birbine benzer karekterleride belirgin olabilmektedir. Özellikle ergenlik döneminde bu özellikleri belirginleşir. Fobiler, hobileri benzer olabilir. Bazen ikizlerden bir daha dışa dönük, girişken ve atak olurken, diğeri içe kapanık ve insanlarla zor iletişim kuran, sadece ikizi ile olmak isteyen bir yapı sergileyebilir.

Sonuç

1920-1960 yılları arasında davranışçı öğrenme teorilerine göre ebeveynler en uygun öğretmenler ve çocuklarının eğitimini yürütmekten sorumlu olanlar olarak görülüyordu. Bu çalışmalarda, çocukların doğuştan sahip oldukları fizyolojik dürtüleri, zamanın öğrenme teorilerinde yer aldı. Yani çevre ve genlerin ortak etkileşiminin birlikte incelenmedi gerektiği gözardı edilmedi fakat asıl vurgu, çevre tarafından uygulanan öğrenme süreçlerinin kontrolünde olmuştur. Bu dönemin psikanalitik teorileri, aile içi erken yaşta deneyimin, sonraki iç çatışmaların, savunma mekanizmalarının ve değerlerin içselleştirilmesinin belirlenmesi üzerinde yoğunlaştı. Son yıllarda bu çalışamalar, bilişsel-sosyal öğrenme teorisi olarak, çocukların kendi sosyalleşmelerinde katılımcı olarak aktif rollerinin dikkate alınması gerekliliği giderek daha yoğun vurgulanmaya başlandı. Fakat yine de bu yaklaşımlar, ebeveynlerin çocuklarının gelişimi  ve yaşamlarının yönlendirmelerine etkisi  fikrini azaltmamıştır. Ama unutmamak gerekir ki ebeveynlik, kültür, eğitim ve sosyal ilişkiler gibi çevresel değişkenler de hayati bir rol oynamaktadır.

Son yıllarda genetiğin gelişimine ve davranış genetiğinin bulgularına bakacak olursak, çocukların davranışlarında genetiğin etkisi genetikçiler tarafından en az %50 olarak kabul edilmektedir. Genetik biliminin gelişimine bağlı olarak yapılan disiplinler arası çalışmalar artık ortak olarak yapılmaktadır. Tüm insanlarındaki genetik farklılık sadece %1’ dir. Binlerce  farklı özelliğin ya da karekterin ortaya çıkmasında ve bu farklı varyasyonların oluşmasında sadece bu %1 farkılılık karar vermektedir. Genetiğin davranıştaki ağırlığını anlayabilmek için vereceğimiz şu örnek önemlidir. Bir çok araştırma için model olarak seçilen Drosophila (Meyve Sineği,) nın sahip olduğu 15.000 genin 4000 adetinin sineğin saldırganlığı ile ilişkili olduğu deneydel olarak belirlenmiştir. Drosophila sineğinin beyninde sadece 100.000 sinir hüücresi vardır.insanla karşılaştıracak olursak, insan beyninde 100.000.000 sinir hücresi vardır. Bunun anlamı bir davranış sadece bir gen değil onlarca genin ortak etkileşimi sonucu ortaya çıkmaktadır ve oldukça komplekstir. Ancak, genetiğin bir çocuğun hayatını oluşturan karmaşık bulmacanın yalnızca bir parçası olduğunu hatırlamak önemlidir.

Prof.Dr.Reşit ÖZKANCA

KAYNAKLAR

Berger, K. S. (2000). The developing person: Through childhood and adolescence. New York: Worth Publishers.

Miko, I. (2008) Genetic dominance: genotype-phenotype relationships. Nature Education 1(1)

JOHN D. LOIKE (2017).Touro Koleji ve Üniversite Sistemlerinde Biyoloji Profesörü olan John D. Loike, The Scientist

Robinson GE. Science. 2004;304:397–399. [PubMed]

Floreano D, Mitri S, Magnenat S, Keller L. Curr Biol. 2007;17:514–591. [PubMed]

Ruan H, Wu CF. Proc Natl Acad Sci. 2008;105:7506–7510. [PMC free article] [PubMed]

Robinson GE, Grozinger CM, Whitfield CW. Nature Rev Gen. 2005;6:1–15.

Young LJ, Nilsen R, Waymire KG, MacGregor GR, Insel TR. Nature. 1999;400:766–768. [PubMed]

Konu ile ilgili yorumlarınızı bekliyorum

Bakterilerde keşfedilen İkozahedral mikrokompartmanların yapısı

Bu ikozahedral yapılar, bakterilerin çeşitli durumlarda kullandığı, özgün geometrik özelliklere sahip proteinlerden oluşur.

Birçok farklı bakteri türü, oldukça çeşitliliği fazla olan ve ardışık kimyasal reaksiyonların yapılmasını sağlayan küçük protein temelli kompartmanlar içerir. Enzim içeriğine bağlı olarak, bölmeler karbon fiksasyonu, enerji üretimi için bazı molekülleri parçalayabilen veya hücreleri stresli koşullardan koruyabilen proteinlerden oluşmaktadır.

Bu ikozahedral yapının bileşenleri; Bakteriyel mikrokompartmanların ana iskelet yapısı üç temel yapısal motifden oluşur ve bunların alt birimleri binlerce protein alt biriminden oluşmaktadır. Bu üç temel motif BMC-T, BMC-H ve BMV olarak adlandırılır.

BMC: Kompartmanların ana kabuk proteini iki ana formdan oluşur: bir hekzameri oluşturan BMC-H ve bir trimeri oluşturan BMC-T. Bu altıgen şekilli bileşenler, ikozahedronun 20 yüzden oluşan  ve substratların içeri girmesine ve dışarı çıkmasına izin veren merkezi bir gözenek sistemine sahiptir. BMC-H yapısındaki gözenekler küçüktür ve  yalnızca bir veya birkaç karbon atomdan oluşan moleküller izin verir. BMC-T gözenekleri ise daha büyük, muhtemelen daha büyük moleküllerin hareketi için daha büyüktür ve bunlar açılabilir veya kapatılabilir.  Dış kabuğu oluşturan motiflerin bazılarının, ikozahedron’un yüzlerinin kenarlarını oluşturmak için büküldüğü düşünülse de, bu konformasyonda hangi tip BMC proteini kullandığı hala net değil.

BMV pentamerik proteinler ise, ikosahedronun köşelerini oluşturur.

 KAYNAK

https://www.the-scientist.com/infographics/infographic–bacterial-microcompartments-basics-65136

Konu ile ilgili yorumlarınızı bekliyorum

ANTİBİYOTİK DİRENÇ PROBLEMİNDE YENİ BİR UMUT

Mikrobiyologlar tarafından yapılan tahminlere göre, antibiyotiğe dayanıklı süper bakterilerin, 2050 yılına kadar sadece Avrupa’da 1,3 milyon insanı öldürebilecek potansiyele sahiptir. Bu nedenle yeni antibiyotik üreten mikroorganizmaların keşfi insanın geleceği ve sağlığı bakımında önemlidir. Dünya Sağlık Örgütü (WHO), sorunu “bugün küresel sağlık, gıda güvenliği ve kalkınma için en büyük tehditlerden biri” olarak tanımlamaktadır.

İrlanda da Bilim insanları, son yıllarda, geniş etkili antibiyotiklere de direnebilen,superbug  olarak adlandırılan bakterilerin üremesini  durdurabilen ve toprakta yaşayan yeni bir bakteri keşfettiler. Bu bakteri, MRSA da dahil olmak üzere antibiyotiklere dirençli altı süper topluluğun dördüne karşı etkili olan ve daha önce daha bilinmeyen bir bakteri suşu olan Streptomyces cinsinin yeni bir türü olduğu tanımlanmıştır. Streptomyces sp. Myrophorea. Yeni bakteri türü, Galler, Brezilya, Irak ve Kuzey İrlanda’dan gelen araştırmacılardan oluşan Swansea Üniversitesi Tıp Fakültesinde bulunan bir ekip tarafından keşfedildi. Bakterinin izole edildiği Toprak yapısı alkali olup, Kuzey İrlanda, Fermanagh bölgesinden alınmıştır.

WHO tarafından sağlıkla ilişkili enfeksiyonlardan sorumlu olarak tanımlanan ilk altı çok dirençli patojenin dördünün yeni keşfedilen Streptomyces sp. myrophorea tarafından büyümesinin durdurulduğu belirlendi. Bu bakterinin etkili olduğu gruplar, Vankomisine dirençli Enterococcus faecium (VRE), metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA), Klebsiella pneumonia ve Carbenepenem’e dirençli  Acinetobacter baumanii.

Yeni keşfedilen Streptomyces sp. myrophorea hem gram negatif ve hem de gram pozitif bakteri karşı etki göstermiştir. Özellikle gram negatiflere etki göstermesi ayrıca önemlidir. Çünkü genellikle gram negatif bakteriler dış membranları nedeniyle antibiyotiklere karşı daha da dirençlidir. İnhibisyona sebep olan etken madde henüz tanımlanmamıştır fakat bu çalışma devam etmektedir.

Çalışma Swansea University’inde yapılmıştır.

Kaynak: https://sciencebulletin.org/

İlgili Makale: Luciana Terra, Paul J. Dyson, Matthew D. Hitchings, Liam Thomas, Alyaa Abdelhameed, Ibrahim M. Banat, Salvatore A. Gazze, Dušica Vujaklija, Paul D. Facey, Lewis W. Francis, Gerry A. Quinn. A Novel Alkaliphilic Streptomyces Inhibits ESKAPE Pathogens. Frontiers in Microbiology (2018). DOI: 10.3389/fmicb.2018.02458

Konu ile ilgili yorumlarınızı bekliyorum

Batı Afrika’da Öldürücü Ebola Virüsü ile Aynı Aileden Olan Marburg Virüsü Tesbit Edildi..

marburg-fruit-bats-thumb-t Batı Afrika'da Öldürücü Ebola Virüsü ile Aynı Aileden Olan Marburg Virüsü Tesbit Edildi..

          Bilim insanları  Batı Afrika ülkesi Sierra Leone’nin üç farklı bölgesindeki beş Mısır rous meyve yarasasınından (Rousettus aegyptiacus)  alınan örneklerde Ebola virüsu ile aynı aileden olan Marburg virüsunu ilk kez tespit ettiler. Bugüne kadar bu virüsun bu bölgede insanlarda enfeksiyona sebep olduğu henüz  görülmedi.  Fakat  son derece ölümcül olan bir Ebola  virüsunun akrabası olmaları insan sağlığı bakımından risk oluşturmaktadır. Uzun zamandır, Marburg virüsünü Afrika’nın diğer bölgelerinde yaşayan  yarasaların Batı Afrika’da da yaşadığını biliniyordu. ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri’nden (CDC) bir ekip yöneten ekolojist Jonathan Towner yapmış olduğu bir yazısında, bu virusun Batı Afrikada yayılış gösterdiğini bilinmekte olduğunu, bu yarasalarda da bulunmasına fazla şaşırtıcı olmadığını bir yazısında rapor etti. Bu bilimsel bilgi, 2016’da Batı Afrika’da Ebola salgını sonrasında Sierra Leone’deki yarasaları örneklemeye başlayan Kaliforniya Üniversitesi Davis (UCD) liderliğindeki CDC ve PREDICT-USAID tarafından yapılan izleme programında belirlenmiştir. Marburg virüsunun genetik dizilimi yapılan Yarasaların dördünde tesbit edilen virüslere yakın olması, bu enfeksiyon ajanının Sierra Leone’de yıllardır bulunduğunu gösteren önemli bir bulgu olmuştur. Marburg virüsunun insanlarda sebep olduğu son salgın 2017’de Uganda’da gerçekleşmiştir.  CDC’ye göre, en büyük Marburg virüs salgını 2005’te Angola’da gerçekleşti ve bu hastalığa yakalanan 252 kişinin yüzde 90’ı öldü. Sierra Leone de yarasalarındaki tesbit edilen yeni viral suşların ikisi Angola suşuna benzemektedir. Bu nedenle Ebola’ya benzer salgınlar yapması kuvvetle muhtemeldir. 

Dec 31, 2018 KERRY GRENS
© ISTOCK.COM, HENDRA SU

Konu ile ilgili yorumlarınızı bekliyorum

Florokinolon antibiyotikleri ve aort anevrizması

 

Florokinolon antibiyotikleri sıklıkla ciddi solunum yolu enfeksiyonları, zatürre, idrar yolu enfeksiyonu ve hatta veba ve antraks tedavisinde kullanılır. Bunlar arasında siprofloksasin (Cipro), gemifloxacin (Factive), levofloksasin (Levaquin), moksifloxacin (Avelox), norfloksasin (Noroksin) ve ofloksasin (Floxin) isimleri altında satılan ilaçlar bulunmaktadır.

Hastalara oral veya enjeksiyon yoluyla verilir.

Bu antibiyotikler İlaçlar aort anevrizmasına neden olabilir, atardamarda büyüyebilir ve patlayabilir, tehlikeli veya ölümcül kanamaya neden olabilir.

Bu antibiyotikleri aldıktan sonra en fazla aort anevrizması riski taşıyan hastalar yaşlılar, yüksek tansiyonu olanlar, aort tıkanıklığı ya da diğer kan damarları tıkanıklığı öyküsü olan kişiler ve Marfan sendromu veya Ehlers gibi genetik koşulları olan kişilerdir.

FDA Komisyon Üyesi Dr. Scott Gottlieb, “Aort anevrizması veya diseksiyonu riski düşük olsa da, hastaların bir fluorokinolon ilacı reçete edildiğinde aort anevrizması veya diseksiyonu yaşama ihtimalinin iki katı olduğunu ifade etti. “Aort anevrizması olan veya aort anevrizması riski altında olduğu bilinen hastalara alternatif tedavi öneriliyor

Bu risk kategorilerine girmeyen hastalar için florokinolonlar hala iyi bir seçenek olabilir. 30 yıldan fazla süredir bakteriyel enfeksiyonlain tedavisinde kullanılan  bir antibiyotiktir.

FDA, bu risklerle ilgili bir uyarının, reçete bilgisine ve hasta ilaç rehberlerine eklenmesini istemektedir.

Temmuz ayında, kurum bu ilaçların kan şekerini önemli ölçüde azaltabileceğini ve zihinsel sağlığı olumsuz yönde etkileyebileceğini ifade edildi. 2016 yılında, FDA, ilaçların kaslar, sinirler, eklemler ve merkezi sinir sistemi üzerinde engelleyici bir yan etkisi olabileceğini ve bazı basit enfeksiyonlarda kullanılmak üzere sınırlandırılması gerektiği söyleniyor

FDA, antibiyotiklerle ilgili her türlü yeni güvenlik endişesini izlemeye devam edeceği ifade ediliyor. Gottleib, “FDA, bu ürünlerle ilgili risk bilgilerini güncel ve kapsamlı bir sekilde takip edecegini duyurdu.

Bunlaradaki risk kategorilerindeyseniz ve bu antibiyotiklerden birini kullanıyorsanız, uzmanlar doktorunuzla bu konuda konuşmanız tavsiye ediliyor.

Konu ile ilgili yorumlarınızı bekliyorum

Gıda zehirlenmesine sebe olan Bacillus cereus toksinin nasıl zarar verdiğinin ve metabolik reaksiyonlarının bilinmesi hayat kurtarabilir..

Avusturalya Ulusal Üniversitesi’nde bir araştırma grubu, özellikle de gıda zehirlenmesi sonucu oluşan  bakteriyel enfeksiyonların  önlemesi ve tedavisinde bir aşama olabilecek yeni bilgilere ulaştılar. Gıda zehirlenmesinin en yaygın nedenlerinden biri, kusmaya ve ishale neden olan toksinleri salgılayan Bacillus cereus adlı bir bakteridir. Sebzeleri, pirinci, makarnaları, balıkları ve etleri kontamine eder  ve yiyecekler uygun sıcaklıkta saklanmazsa bu bakterilerin çoğalmasına sebep olur.

Okumaya devam et “Gıda zehirlenmesine sebe olan Bacillus cereus toksinin nasıl zarar verdiğinin ve metabolik reaksiyonlarının bilinmesi hayat kurtarabilir..”

Balcıları zarara uğratan ve 7 türü bilinen bal arısı parazitlerinden birisi olan küçük kovan böceği genomu belirlendi

Araştırmacılar, bilim adamları tarafından küçük kovan böceğinin genomunun belirlenmesi bal üreticilerini memnun edecek. Küçük kovan böceği (SHB), az sayıda etkili tedavinin olduğu bal arılarının önemli bir parazit problemidir. SHB genomunun tamamlanması, buna yakin diger zararlı  akraba türlerinin anlaşılmasına büyük hizmet edecektir.

20 Aralık 2018
Kaynak:
ABD Tarım Bakanlığı – Tarımsal Araştırma Hizmetler Birimi

Konu ile ilgili yorumlarınızı bekliyorum

Mitekondriyal Genetikte Santral Dogma Bilgisi (Maternal ve Paternal Kalıtım) Yeniden Revize Edilebilir

Son zamanlarda mitokondriyal DNA’nın maternal ve paternal kalıtımdaki geçişleri ile ilgili  17 kişiden elde edilen bilimsel bilgiler, tıbbi ve atalara yönelik araştırmalarda büyük yankı uyandıracak gibi. Bu yeni verilere ulaşıncaya kadar, genellikle mitokondri ve onların DNA’sının insanlarda anneden gelen bir kalıtım olduğuna inanılıyordu. PNAS’da yayınalanan  bir raporda, bilim adamları, anneleri ve erkek atalarından mitokondriyal DNA’yı (mtDNA) yüksek düzeyde alan üç ilişkisiz aileden 17 kişiyi belirledi. Şimdi, “mitokondriyal kalıtım” bilgilerinin yeniden gözden geçirilmesi gerekmektedir.

IVF tarafından üretilen insan poliploid embriyolarını kullanan ve daha önce yapılan insan çalışmaları, gelişimin sekiz hücresi aşamasına kadar yalnızca paternal mtDNA’yı tesbit etmişti. Bununla birlikte, 2002 yılında, maternal ve paternal mtDNA’yı ifade eden, kasları etkileyen bir durum olan mitokondriyal miyopatisi olan erkekle ilgili yayınlanmış tek bir raporu vardı. Bu gözlem, insanlarda (yosunlar, bitkiler, maya ve Drosophila dahil olmak üzere) katı paternal mtDNA mirasını sergilemesinde önemliydi.

Bu çalışmanın bilimsel, tıbbi ve etik yönden ispatlanabilmesi için daha fazla bilimsel veri gerekmektedir. İlk olarak şu sorulara cevap verilmesi gerekir; , paternal mtDNA’nın döllenmiş oosit tarafından elimine edildiğinin  kesin mekanizmasının bilinmesi gerekir. . İkinci soru, paternal mtDNA aktarımının mtDNA işlemindeki bir sporadik mutasyondan mı kaynaklanmaktadır yoksa normal mitokondriyal metabolizmanın bir sonucumudur ? Son olarak, mtDNA’nın babadan gelen bir kalıtımsal işlem olduğunun oranı nedir ?

Babanın Mitokondriyal DNA’sı Çocuklara Geçebilir”

Bu soruların cevapları geçmiş ve gelecekteki tıbbi çalışmaları etkileyecektir. Anne ebeveynden genetik kökenleri inceleyen birçok çalışma yapılmıştır. Örneğin, 2017’den bir çalışma, otizm ile belirli mitokondriyal haplotipler arasında bir genetik bağlantı  olduğu tesbit edilmişti.

Eğer önemli sayıda insan hem maternal hem de paternal mtDNA’ya sahipse, mtDNA’nın kalıtımdaki yerinin yeniden değerlendirilmesini gerekecektir.

Tarihsel bir bakış açısıyla, paternal mtDNA iletimi, tüm yaşayan insanların maternal ataları olan “mitokondriyal Havva” ile ilgili iki klasik ama tartışmalı raporun yeniden yorumlanmasına yol açabilir. 1987 yılında, bilim adamları, “tüm mitokondriyal DNA’ların bir kadından kaynaklandığını” ve muhtemelen yaklaşık 200,000 yıl önce Afrika’da yaşadığını gösteren dünya çapında bir insan mtDNA anketinin sonuçlarını yayınlamışlardı. Havva, 200.000 yıl önce yaşamış olan tüm insanların annesini doğrulamak için mitokondriyal genomların önemli bir kanıttı. Eğer babadan gelen Paternal bulaşma sık değilse, o zaman bu çalışmalar yeniden gözden geçirilmelidir. Bu sonuç yahudilerin kalıtımsal geçişinde anneden gelen mitekondriyal DNA önemlidir. Eğer babadan gelen özellikler de söz konusu ise bu yahudilerin tezlerini zayıflatacaktır.

Etik açıdan bakıldığında, paternal mtDNA’nın çocuklara geçişinin ne kadar yaygın olduğu sorusu özellikle önemlidir. Ebeveynlik kurmanın etik karmaşıklığı İsrail’de özellikle ilgili olabilir. Geçtiğimiz yıl maternal yolla aktarılan mitokondriyal genetik belirteçler olan K1a1b1a, K1a9, K2a2a ve N1b’nin Aşkenaz Yahudileri arasında yaygın olduğu, ancak nadiren başkalarında görüldüğü iddia edildi. Yahudilik sadece maternal olarak aktarıldığı için, bu genetik belirteçlerden birine sahip olan birçok İsrail rabbinist uzmanı tarafından Yahudi soylarının güvenilir bir yasal ve dini göstergesi olarak görülmüştür. Bununla birlikte, paternal mtDNA nadir bir kalıtsal olay değilse, o zaman bu rabbinik uzmanlar tarafından, bu mtDNA genetik belirleyicilerin aslında Yahudi olmanın geçerli bir dini göstergesi olup olmadıkları tam bir yeniden analiz gerektirecektir.

Yeni biyoteknolojilerin bilimsel dogmayı yeniden biçimlendirebileceği bir çağda yaşıyoruz. Örneğin, Santral DNA dogması DNA’nın mRNA’ya transkribe edildiğini ve proteinlere çevrilmesi olarak literatürde tanımlanmıştır. Fakat, retrovirüslerdeki ters transkriptazın keşfi, bu enzim DNA’nın DNA’ya transkribe edilebilmesi nedeniyle, bu temel biyoloji ilkesine bir modifikasyon gerektirmiştir. Bu tür keşiflerin çoğunda etik sonuçlar bulunmamakla birlikte, son zamanlarda paternal mtDNA aktarımının keşfedilmesi, uzun yıllar boyunca tartışılacak olan derin bilimsel, etik ve dini sonuçlara sahip olabilir.

12 Aralık 2018

JOHN D. LOIKE

Touro Koleji ve Üniversite Sistemlerinde Biyoloji Profesörü olan John D. Loike, The Scientist için biyoetik üzerine düzenli bir köşe yazısı yazıyor.

Konu ile ilgili yorumlarınızı bekliyorum

E.coli, Pseudomonas ve Burkholderia biyofilm ve hareketli form nasil saglanmaktadir ?

Çoğu bakteri, planktonik, kimi zaman hareketli bir form ve bakteriyel hücrelerin katı bir yüzeye toplanabildiği ve bağlanabildiği bir biyofilm oluşturabilme yeteneğine sahiptirler. Bu iki form arasındaki geçiş, çevresel sinyallere ve streslere karşı bakteriyel adaptasyonun bir cevabi olarak ortaya çıkar . ‘Biyofilmin ne zaman oluşacağı ortamdaki sartlara bağlı olarak değişiklik gösterir.  Bu bakterilerin Biyofilm olusturmalarinda  açlık stresi, hayvanlarda ve insanlarda hastalığa neden olabilen çevresel bakteriler, sıcaklık, oksijen mevcudiyeti, besin konsantrasyonu vb gibi  dış ortamla ilişkili sinyaller önemli bir rol oynamaktadır. Hareketli ve biyofilm modu arasındaki geçişin tetiklenmesinde, flagellar sentez ve motiliteyi kontrol eden karmaşık düzenleyici mekanizmalar ve adezyon faktörlerinin üretimi yoluyla olmaktadır. Bu  yazıda, çevresel sinyallerin Gram negatif bakteriler Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli ve Burkholderia cinsindeki biyofilm oluşumu ve hücre motilitesini nasıl etkileyebileceğine ve hareketli ve biyofilm modu arasındaki geçişin nasıl düzenlendiği önem taşımaktadır

Biofilm and motility in response to environmental and host‐related signals in Gram negative opportunistic pathogens

First published: 28 August 2018

https://onlinelibrary.wiley.com/journal/13652672

Konu ile ilgili yorumlarınızı bekliyorum